MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020134	ACAA	2	8	308	315	75 %	0 %	0 %	25 %	442803497
2	NC_020134	AGT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
3	NC_020134	ATT	3	9	390	398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
4	NC_020134	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	442803497
5	NC_020134	CGG	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803497
6	NC_020134	GAACA	2	10	584	593	60 %	0 %	20 %	20 %	442803497
7	NC_020134	TGTA	2	8	609	616	25 %	50 %	25 %	0 %	442803497
8	NC_020134	TTA	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
9	NC_020134	GAT	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
10	NC_020134	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
11	NC_020134	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803497
12	NC_020134	GAA	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
13	NC_020134	ATT	2	6	806	811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
14	NC_020134	GGA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803497
15	NC_020134	A	6	6	935	940	100 %	0 %	0 %	0 %	442803497
16	NC_020134	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
17	NC_020134	AT	3	6	982	987	50 %	50 %	0 %	0 %	442803497
18	NC_020134	GTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803497
19	NC_020134	AGC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803497
20	NC_020134	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803497
21	NC_020134	GAAA	2	8	1203	1210	75 %	0 %	25 %	0 %	442803497
22	NC_020134	TCTT	2	8	1273	1280	0 %	75 %	0 %	25 %	442803497
23	NC_020134	GGA	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803497
24	NC_020134	AGAA	2	8	1360	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	442803497
25	NC_020134	AAG	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
26	NC_020134	GAA	2	6	1399	1404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
27	NC_020134	AT	3	6	1518	1523	50 %	50 %	0 %	0 %	442803498
28	NC_020134	A	6	6	1554	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	442803498
29	NC_020134	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	442803498
30	NC_020134	CAA	2	6	1623	1628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803498
31	NC_020134	TTA	2	6	1641	1646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803498
32	NC_020134	TAA	2	6	1721	1726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803499
33	NC_020134	TAC	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
34	NC_020134	GGAA	2	8	1796	1803	50 %	0 %	50 %	0 %	442803499
35	NC_020134	TAC	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
36	NC_020134	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
37	NC_020134	TGT	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803499
38	NC_020134	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803499
39	NC_020134	CAG	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803499
40	NC_020134	AT	3	6	2127	2132	50 %	50 %	0 %	0 %	442803499
41	NC_020134	ATG	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803499
42	NC_020134	AAAAT	2	10	2152	2161	80 %	20 %	0 %	0 %	442803499
43	NC_020134	GTT	2	6	2259	2264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803499
44	NC_020134	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	442803499
45	NC_020134	AT	3	6	2304	2309	50 %	50 %	0 %	0 %	442803499
46	NC_020134	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803499
47	NC_020134	TTTG	2	8	2366	2373	0 %	75 %	25 %	0 %	442803499
48	NC_020134	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803499
49	NC_020134	GA	3	6	2499	2504	50 %	0 %	50 %	0 %	442803499
50	NC_020134	GAA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803499
51	NC_020134	ATT	2	6	2550	2555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803499
52	NC_020134	ATTT	2	8	2709	2716	25 %	75 %	0 %	0 %	442803499
53	NC_020134	TG	3	6	2736	2741	0 %	50 %	50 %	0 %	442803499
54	NC_020134	ATA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
55	NC_020134	T	7	7	3020	3026	0 %	100 %	0 %	0 %	442803500
56	NC_020134	ATA	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
57	NC_020134	ATT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
58	NC_020134	AAATA	2	10	3073	3082	80 %	20 %	0 %	0 %	442803500
59	NC_020134	A	6	6	3099	3104	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
60	NC_020134	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
61	NC_020134	A	7	7	3122	3128	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
62	NC_020134	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
63	NC_020134	GTT	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803500
64	NC_020134	T	6	6	3169	3174	0 %	100 %	0 %	0 %	442803500
65	NC_020134	AGA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
66	NC_020134	TAAAAA	2	12	3296	3307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	442803500
67	NC_020134	TAT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
68	NC_020134	A	9	9	3317	3325	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
69	NC_020134	AGAT	2	8	3340	3347	50 %	25 %	25 %	0 %	442803500
70	NC_020134	AAG	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
71	NC_020134	A	6	6	3421	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
72	NC_020134	GAA	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
73	NC_020134	A	6	6	3542	3547	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
74	NC_020134	CAG	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803500
75	NC_020134	GGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803500
76	NC_020134	A	6	6	3709	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	442803500
77	NC_020134	TGA	2	6	3740	3745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
78	NC_020134	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
79	NC_020134	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
80	NC_020134	GAT	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
81	NC_020134	CGTA	2	8	3865	3872	25 %	25 %	25 %	25 %	442803500
82	NC_020134	AAT	2	6	3998	4003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
83	NC_020134	T	6	6	4043	4048	0 %	100 %	0 %	0 %	442803501
84	NC_020134	GGA	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803501
85	NC_020134	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
86	NC_020134	TAA	2	6	4136	4141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
87	NC_020134	CT	3	6	4149	4154	0 %	50 %	0 %	50 %	442803501
88	NC_020134	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803501
89	NC_020134	TA	3	6	4174	4179	50 %	50 %	0 %	0 %	442803501
90	NC_020134	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	442803501
91	NC_020134	TAA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
92	NC_020134	A	6	6	4254	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	442803502
93	NC_020134	ATG	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803502
94	NC_020134	GTAT	2	8	4318	4325	25 %	50 %	25 %	0 %	442803502
95	NC_020134	TCA	2	6	4352	4357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
96	NC_020134	TGA	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803502
97	NC_020134	ATT	2	6	4428	4433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803502
98	NC_020134	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803502
99	NC_020134	TTCA	2	8	4537	4544	25 %	50 %	0 %	25 %	442803502
100	NC_020134	G	6	6	4581	4586	0 %	0 %	100 %	0 %	442803502
101	NC_020134	TGC	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803502
102	NC_020134	ATGG	2	8	4628	4635	25 %	25 %	50 %	0 %	442803502
103	NC_020134	ACAG	2	8	4666	4673	50 %	0 %	25 %	25 %	442803502
104	NC_020134	TAC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
105	NC_020134	T	6	6	4826	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	442803502
106	NC_020134	AT	3	6	4928	4933	50 %	50 %	0 %	0 %	442803502
107	NC_020134	ACG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803502
108	NC_020134	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
109	NC_020134	AT	3	6	4968	4973	50 %	50 %	0 %	0 %	442803502
110	NC_020134	GAGATA	2	12	4998	5009	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442803502
111	NC_020134	GGC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
112	NC_020134	GGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
113	NC_020134	TAAT	2	8	5122	5129	50 %	50 %	0 %	0 %	442803502
114	NC_020134	GGAA	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	442803502
115	NC_020134	TTG	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803502
116	NC_020134	GGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803502
117	NC_020134	AAT	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
118	NC_020134	AAGG	2	8	5402	5409	50 %	0 %	50 %	0 %	442803502
119	NC_020134	TG	3	6	5497	5502	0 %	50 %	50 %	0 %	442803502
120	NC_020134	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803502
121	NC_020134	GGAG	2	8	5516	5523	25 %	0 %	75 %	0 %	442803502
122	NC_020134	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
123	NC_020134	AGA	2	6	5559	5564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
124	NC_020134	TTC	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803502
125	NC_020134	ATA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
126	NC_020134	TAA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
127	NC_020134	TCA	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
128	NC_020134	GCT	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803502
129	NC_020134	T	6	6	5780	5785	0 %	100 %	0 %	0 %	442803502
130	NC_020134	TTGA	2	8	5805	5812	25 %	50 %	25 %	0 %	442803502
131	NC_020134	CCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803502
132	NC_020134	AGA	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
133	NC_020134	TA	3	6	5881	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	442803502
134	NC_020134	GAAG	2	8	5937	5944	50 %	0 %	50 %	0 %	442803502
135	NC_020134	ACA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803502
136	NC_020134	AAT	2	6	6048	6053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
137	NC_020134	A	6	6	6134	6139	100 %	0 %	0 %	0 %	442803502
138	NC_020134	TAA	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
139	NC_020134	GAA	2	6	6160	6165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
140	NC_020134	AT	3	6	7095	7100	50 %	50 %	0 %	0 %	442803503
141	NC_020134	TTC	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
142	NC_020134	TTG	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803503
143	NC_020134	TTC	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
144	NC_020134	CCTTT	2	10	7233	7242	0 %	60 %	0 %	40 %	442803503
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151	NC_020134	TA	3	6	7726	7731	50 %	50 %	0 %	0 %	442803503
152	NC_020134	TACA	2	8	7749	7756	50 %	25 %	0 %	25 %	442803503
153	NC_020134	TAG	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803503
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159	NC_020134	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803503
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249	NC_020134	A	6	6	14071	14076	100 %	0 %	0 %	0 %	442803508
250	NC_020134	GCG	2	6	14388	14393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803508
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252	NC_020134	GACA	2	8	14456	14463	50 %	0 %	25 %	25 %	442803508
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258	NC_020134	A	6	6	14873	14878	100 %	0 %	0 %	0 %	442803508
259	NC_020134	GGA	2	6	14935	14940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803508
260	NC_020134	AGA	2	6	14971	14976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803508
261	NC_020134	TCC	2	6	14986	14991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803508
262	NC_020134	TGA	2	6	15010	15015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803508
263	NC_020134	TTCT	2	8	15036	15043	0 %	75 %	0 %	25 %	442803508
264	NC_020134	CAG	2	6	15164	15169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803508
265	NC_020134	TGA	2	6	15205	15210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803508
266	NC_020134	GGT	2	6	15235	15240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803508
267	NC_020134	CAC	2	6	15277	15282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803509
268	NC_020134	TGA	2	6	15291	15296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803509
269	NC_020134	CAA	2	6	15327	15332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803509
270	NC_020134	GT	3	6	15346	15351	0 %	50 %	50 %	0 %	442803509
271	NC_020134	A	8	8	15395	15402	100 %	0 %	0 %	0 %	442803509
272	NC_020134	T	6	6	15415	15420	0 %	100 %	0 %	0 %	442803509
273	NC_020134	CGTATA	2	12	15596	15607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442803509
274	NC_020134	GTT	2	6	15682	15687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803509
275	NC_020134	AT	3	6	15696	15701	50 %	50 %	0 %	0 %	442803509
276	NC_020134	GAA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803509
277	NC_020134	CTT	2	6	15724	15729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803509
278	NC_020134	TA	3	6	15733	15738	50 %	50 %	0 %	0 %	442803509
279	NC_020134	GCG	2	6	15832	15837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803509
280	NC_020134	T	6	6	15963	15968	0 %	100 %	0 %	0 %	442803509
281	NC_020134	A	7	7	15989	15995	100 %	0 %	0 %	0 %	442803509
282	NC_020134	AAGA	2	8	16038	16045	75 %	0 %	25 %	0 %	442803509
283	NC_020134	TAT	2	6	16130	16135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803510
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285	NC_020134	CGG	2	6	16208	16213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803510
286	NC_020134	T	6	6	16350	16355	0 %	100 %	0 %	0 %	442803510
287	NC_020134	A	6	6	16469	16474	100 %	0 %	0 %	0 %	442803510
288	NC_020134	GTG	2	6	16547	16552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803511
289	NC_020134	AAT	2	6	16637	16642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803511
290	NC_020134	T	6	6	16656	16661	0 %	100 %	0 %	0 %	442803511
291	NC_020134	TTG	2	6	16836	16841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803511
292	NC_020134	CTT	2	6	16853	16858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803511
293	NC_020134	AT	3	6	16877	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	442803511
294	NC_020134	A	8	8	17056	17063	100 %	0 %	0 %	0 %	442803512
295	NC_020134	A	6	6	17133	17138	100 %	0 %	0 %	0 %	442803512
296	NC_020134	A	6	6	17183	17188	100 %	0 %	0 %	0 %	442803512
297	NC_020134	AT	3	6	17488	17493	50 %	50 %	0 %	0 %	442803512
298	NC_020134	TAT	2	6	17500	17505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803512
299	NC_020134	AAT	2	6	17513	17518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803512
300	NC_020134	A	9	9	17581	17589	100 %	0 %	0 %	0 %	442803512
301	NC_020134	AT	3	6	17928	17933	50 %	50 %	0 %	0 %	442803513
302	NC_020134	GCT	2	6	17948	17953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803513
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306	NC_020134	ATT	2	6	18026	18031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803513
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332	NC_020134	TGA	2	6	19632	19637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803514
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343	NC_020134	TCA	2	6	20228	20233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803514
344	NC_020134	ATT	2	6	20255	20260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803514
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358	NC_020134	A	6	6	21118	21123	100 %	0 %	0 %	0 %	442803514
359	NC_020134	CATA	2	8	21131	21138	50 %	25 %	0 %	25 %	442803514
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369	NC_020134	CA	3	6	21802	21807	50 %	0 %	0 %	50 %	442803515
370	NC_020134	AG	3	6	21897	21902	50 %	0 %	50 %	0 %	442803515
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377	NC_020134	CA	3	6	22218	22223	50 %	0 %	0 %	50 %	442803515
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380	NC_020134	GAT	2	6	22275	22280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803515
381	NC_020134	GAAGA	2	10	22359	22368	60 %	0 %	40 %	0 %	442803515
382	NC_020134	CAA	2	6	22400	22405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803515
383	NC_020134	GCT	2	6	22409	22414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803515
384	NC_020134	ATGG	2	8	22454	22461	25 %	25 %	50 %	0 %	442803515
385	NC_020134	GAA	2	6	22492	22497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803515
386	NC_020134	GAAA	2	8	22525	22532	75 %	0 %	25 %	0 %	442803515
387	NC_020134	ATTGG	2	10	22555	22564	20 %	40 %	40 %	0 %	442803515
388	NC_020134	AAGG	2	8	22737	22744	50 %	0 %	50 %	0 %	442803515
389	NC_020134	CCAA	2	8	22752	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	442803515
390	NC_020134	TA	3	6	22875	22880	50 %	50 %	0 %	0 %	442803515
391	NC_020134	CTG	2	6	22970	22975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803515
392	NC_020134	CATG	2	8	23009	23016	25 %	25 %	25 %	25 %	442803515
393	NC_020134	AGC	2	6	23017	23022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803515
394	NC_020134	AT	3	6	23081	23086	50 %	50 %	0 %	0 %	442803515
395	NC_020134	ATC	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803515
396	NC_020134	GGC	2	6	23172	23177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803515
397	NC_020134	TTG	2	6	23200	23205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803515
398	NC_020134	CAG	2	6	23276	23281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803515
399	NC_020134	ACGC	2	8	23330	23337	25 %	0 %	25 %	50 %	442803515
400	NC_020134	ACAAAT	2	12	23347	23358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442803515
401	NC_020134	TGA	2	6	23387	23392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803515
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